增值税审计有哪几种方法

一是对增值税专用发票的审计。主要检查纳税人是否取得增值税专用发票，是否存在以增值税普通发票抵扣进项税的情况。主要通过对存货、固定资产、费用科目和应交税费――应交增值税（进项税）等科目进行审计。
二是对海关进口增值税专用缴款书的审计。在进口货物办理报关进口手续时，纳税人需向海关申报缴纳进口增值税并从海关取得完税证明即海关进口增值税专用缴款书（简称海关专缴书）。
三是对农产品收购凭证的审计。按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算的进项税额。