别墅花园挖地下室违规吗

解析：
在某些特定条件下，假如别墅用户已向住建部门递交申请并得到审批通过，那么此类房屋便不在违章建筑之列了。
而在通常情况下，政府机构认定违章建筑的主要依据为《中华人民共和国城乡规划法》。
该法规详尽规定，唯有获得规划许可证书或者严格遵循规划批准书中规定实施建设活动者，方可被视为合法建筑物；反之，未能符合上述条件所建成的建筑，将会面临包括限期拆除在内的各种行政处理措施。
法律依据：
《城乡规划法》第四十条
在城市、镇规划区内进行建筑物、构筑物、道路、管线和其他工程建设的，建设单位或者个人应当向城市、县人民政府城乡规划主管部门或者省、自治区、直辖市人民政府确定的镇人民政府申请办理建设工程规划许可证。申请办理建设工程规划许可证，应当提交使用土地的有关证明文件、建设工程设计方案等材料。需要建设单位编制修建性详细规划的建设项目，还应当提交修建性详细规划。对符合控制性详细规划和规划条件的，由城市、县人民政府城乡规划主管部门或者省、自治区、直辖市人民政府确定的镇人民政府核发建设工程规划许可证。城市、县人民政府城乡规划主管部门或者省、自治区、直辖市人民政府确定的镇人民政府应当依法将经审定的修建性详细规划、建设工程设计方案的总平面图予以公布。