通常来讲,要是你跟公司针对赔偿这事儿已经达成了那种具有法律效应的协商协议,并且公司也依照协议把该履行的义务都完成了,那之后再去申请劳动仲裁的概率就不是很大。不过,如果协商协议出现了下面这些情形,那还是可以申请劳动仲裁的。比如说,这个协议是在对方实施了欺诈行为,或者对你进行了胁迫,又或者是趁你处于危难之际逼迫你签订的,并非是你内心真实的想法和意愿。再比如,协议的内容违反了国家法律法规的那些强制性规定,是不合法的。还有就是公司没有按照协商好的协议去履行赔偿的义务。总而言之,到底能不能进行劳动仲裁,得全面地考虑协商协议的具体状况以及履行的情况。所以,你一定要好好地保存好与协商相关的所有证据材料,万一以后有什么需要,就能派上用场。