我家现在因为土地确权的问题发生了纠纷，不知道要怎么处理。想要问一下土地确权中存在的矛盾纠纷要怎么处理呢？

农村土地承包权确权涉及的土地面积大，户数多，且农户承包地块分散，土地质量差异大，地形不一，空间标记存在困难，确权任务繁重。农村乡镇相关工作人员数量少，登记工作力不从心。同时，由于种种历史遗留问题，造成承包地块面积不准、“四至”不清、空间位置不明，给确权工作带来困难。
由于各村干部及农户人口变化大，农户实际耕种的承包地、自留地等土地难以准确区分类别，容易造成承包地总面积增大，影响了确权面积准确性。又如承包土地时，明确规定果园地不允许承包，但有的果园地也登记在权证上。1998年农村土地“二轮延包”时，土地是按面积平均发包到人，由于在不同区域土质差异大，按照地力肥瘦折扣标准计算后，相同承包人口的家庭，土质差的承包土地面积相对较宽，土质好的承包面积相对少，使得目前确权实测后各户人均面积不一致，导致按照实测面积据实确权难以顺利推进。
农村土地承包法规定，拥有该土地的承包权以承包合同为依据，但存在一些对承包政策操作不规范，落实不到位的问题，承包台账、承包合同、承包权证等档案资料记载信息不完整、不准确，直接影响土地承包确权的落实。主要表现，一是“二轮延包”时部分农户土地承包信息登记不准确，位置不明，面积不准。二是在土地多轮流转、公益设施建设用地占用农田，农户间互换田地后，却没有及时完善相关手续，造成农户承包证书上的地块面积与实际面积不一致的“证地”不符。三是承包台账和承包合同中对土地面积等信息记载不相吻合，承包权证没有以承包合同中的信息登记内容为依据，而是以台账为依据，造成登记信息不准确。
近年来，随着国家取消农业税、粮食补贴等一系列惠农政策的出台以及新农村建设土地占用的增加，农村集体土地价值上升，农民对土地确权利益期望增多，在确权过程中承包土地权属争议和纠纷渐渐增多。尤其是“二轮延包”遗留问题使得复杂的土地承包纠纷在此次确权落实过程中显现出来，且目前村委会和乡镇经营管理指导站主要承担基层土地承包经营权纠纷调解，协调解决难度非常大，影响土地承包确权的落实。农村土地承包法规定，拥有该土地承包经营权以承包合同为依据，但实际工作中一些承包合同中土地承包关系信息不清问题引发土地纠纷相对突出。如实际土地承包经营状况与发证情况不相吻合。又如，土地按面积平均发包到人，由于在不同区域土质差异大，按照折扣标准计算后，土质差的家庭承包土地面积相对较宽，使得目前确权实测后各户人均面积不一致，承包面积相对少的农户则不同意按实有面积确权，只接受按平均实测面积确权，导致据实确权难以顺利推进。
由于配套机制滞后及土地承包难确权导致土地承包权有偿退出难，土地经营权在抵押贷款、银行融资等方面作用难以得到发挥。一是尚未建立专业的土地经营权评估机构。农地经营权价值是金融机构授确定信贷款额度的基础，而目前专业的土地经营权价值评估机构和具有专业资质的评估人员匮缺。二是缺乏真正意义上的土地流转中介机构和土地仲裁机构，在借款人出现经营风险、缺乏偿还能力时，对土地经营权处置带来一定困难，权属登记缺乏法律效力，金融机构债权难以得到保护。