我们公司业务量大工作人员少，经常加班加点连节假日都不休息，这我都能忍了，可是最近我家中有事请了2天假，结算工资时用我的加班工资抵消了我的请假，请问公司用平时请假周日加班的时间做抵消合理吗？

是可以的。平时请假扣双休加班其实是倒休的一种说法，就是说你双休日上班了，然后平时有事请假就不用扣工资，直接用双休加班的时间冲抵即可，是符合《劳动法》规定的。即：劳动者周休息日有加班，应当先安排同等时间的补休，不能补休的应支付加班费。
相关法规条款：
《劳动法》第四十四条　有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
　　（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；