综合工时制扣除吃饭时间是否合法

针对公司员工因执行加班任务而扣除用餐时间是否合理的问题，回答如下：如果雇主决定延长工作时长，那么在这段用餐期间，员工实际上并没有进行任何劳动活动，因此在计算加班费用时，实际的加班时间的薪酬标准不得低于该名员工正常工作日薪资的百分之一百五十。
《中华人民共和国劳动法》第四十四条
有下列情形之一的，用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬：
（一）安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。