手写的协议复印件有效吗

有效，只要是双方真实意思表示且不违反法律规定。但是如果从法律风险上说，仍建议采取书面原件的方式，以防发生纠纷的时候无法证明双方当时的合意，保障当事人的权益。

从证据角度来说，复印件是图片，作为复印件的形式存在，从技术上可以被篡改，因此单单复印件的证明效力是很低的，除非对方对复印件认可，否则需要提供其它相关证据进行佐证，形成证据链条，复印件才能作为定案证据，从而具有较高证明效力。

法律依据：

《民事诉讼法》第七十条 书证应当提交原件。物证应当提交原物。提交原件或者原物确有困难的，可以提交复制品、照片、副本、节录本。 提交外文书证，必须附有中文译本。