土地流转合同户主本人没去配偶签字有效么

首先，家庭承包地使用流转的协议是有效的。根据《农村土地承包经营权流转管理办法》第二十一条规定，承包方流转农村土地承包经营权，应当与受让方在协商一致的基础上签订书面流转合同。农村土地承包经营权流转合同一式四份，流转双方各执一份，发包方和乡（镇）人民政府农村土地承包管理部门各备案一份。流转合同的备案制度不同于登记制度，既然登记都不是流转合同生效的条件，备案制度更不能成为合同生效的必要条件。土地权利的变动依当事人的意思表示而产生法律效力，交易完成，土地权利即发生转移，当事人可以登记也可以不登记，但不登记的，其权利不得对抗善意第三人。当前，我国的农村土地承包经营权登记制度尚不健全，而农户家要求土地承包经营权流转必须登记，既不现实，也不可能。从物权公示的必要性来讲，由于流转的范围都是当地附近的农民，互相比较熟悉，登记的必要性也不大。此外，如果采取登记生效主义，大量的登记费用无疑会加重农民的负担。而备案制度从公示、公信的角度来看，具有与登记相类似的功能，既然登记都不能成为合同是否生效的条件，备案制度更不能成为判断合同是否有效的必要条件。因此，您与乙方是在真实意思表示下签订协议，且经过村委会盖章见证，故流转协议合法有效。
其次，针对上述情况您可以要求村委会出面进行调解，要求对方配合办理相关手续。如果一方不出面配合处理纠纷，那么可以按照你们签订的流转协议约定要求乙方承担违约责任。
最后，虽然乙方并不是业主，且其户主并不知情，但是其不得对抗善意第三人。因此，该流转协议是有效的。