我叔叔成立的这家公司有5年的时间了，因为工厂一些发生事故的人员基本都还是在这里上班，考虑公司效率得罪都会，准备辞退一些人，所以公司可以辞退残疾员工吗？

不可以。发生争议之后，建议先协商，协商不成，可以搜集证据，去劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁。劳动仲裁是指由劳动争议仲裁委员会对当事人申请仲裁的劳动争议居中公断与裁决。在我国，劳动仲裁是劳动争议当事人向人民法院提起诉讼的必经程序。按照《劳动争议调解仲裁法》规定，提起劳动仲裁的一方应在劳动争议发生之日起一年内向劳动争议仲裁委员会提出书面申请。除非当事人是因不可抗力或有其他正当理由，否则超过法律规定的申请仲裁时效的，仲裁委员会不予受理。
二、企业辞退的原则
根据原劳动人事部等四部门劳人劳[1987]5号文件规定：企业对职工要坚持教育为主，惩罚为辅的原则，切实做好思想教育工作，帮助他们改正错误。对于那些经过教育或行政处分后仍然无效的，可以按照《辞退规定》予以辞退。
企业辞退职工坚持实事求是，严格按照《辞退规定》办事。如发现辞退不当的，要及时纠正;发现确属企业领导人滥用的职权，要按照有关规定进行严肃处理。
企业对被辞退的职工，要认真做好思想教育工作，不能简单从事，防止矛盾激化。辞退后，本人要求迁移户口的，按户口迁移规定办理。