宅基地超占，院墙超占是不是交了罚款就行了？

不是。农民未取得宅基地使用权(无宅基地使用证)而修建的住房,如农民超出宅基地范围扩建的住房或新建的住房，肯定也未取得乡村建设规划许可证，属于违建建筑，按照各地政府要求，需恢复原状。
根据第《城乡规划法》六十五条　在乡、村庄规划区内未依法取得乡村建设规划许可证或者未按照乡村建设规划许可证的规定进行建设的，由乡、镇人民政府责令停止建设、限期改正；逾期不改正的，可以拆除。