如果劳动者不是在加班时间请假,则单位扣加班费违法。劳动者请事假,用人单位可以不支付在此期间的工资,但与加班费无关。劳动者在工作日加班,用人单位支付不低于平时工资1.5倍的加班费;在休息日加班单位又不安排补休的,支付不低于平时工资2倍的加班费;在法定节假日加班,单位要支付不低于平时工资3倍的加班费。法律依据:《中华人民共和国劳动法》第四十四条 有下列情形之一的,用人单位应当按照下列标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬:
(一)安排劳动者延长时间的,支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬;
(二)休息日安排劳动者工作又不能安排补休的,支付不低于工资的百分之二百的工资报酬;
(三)法定休假日安排劳动者工作的,支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。