在申请劳动仲裁这段时间,是可以选择辞职的。劳动者本身就有自主选择职业的权利,他们有权决定到底还要不要在原来的单位继续干下去。要是决定辞职,那一定要记得把相关的证据给保留好,像辞职信,还有办理离职手续的那些材料之类的,这样就能证明自己辞职的意愿和行为。并且,辞职这个行为一般不会对劳动仲裁的进行产生影响,仲裁还是会按照之前定好的程序来处理。不过,如果单位有拖欠工资或者没给缴纳社保这些违法的情况,劳动者要是以这个为由辞职并且想要主张经济补偿的话,就需要在辞职通知里把理由说得明明白白的,这样在后面的劳动仲裁中就能当作依据。
总之,申请劳动仲裁的时候是可以辞职的,一定要把相关的事情处理好,这样才能更好地维护自己的合法权益。