三方协议写错能修改吗，付款金额写错

不可以，因为备案合同在银行和房管局均有备案，无法修改。而且银行是先收取正式合同（也就是备案合同），然后根据合同金额和申请贷款的金额进行核实。所以备案了无法更改。《城市房地产转让管理规定》第七条房地产转让，应当按照下列程序办理:
(一)房地产转让当事人签订书面转让合同;
(二)房地产转让当事人在房地产转让合同签订后90日内持房地产权属证书、当事人的合法证明、转让合同等有关文件向房地产所在地的房地产管理部门提出申请，并申报成交价格;
(三)房地产管理部门对提供的有关文件进行审查，并在7日内作出是否受理申请的书面答复，7日内未作书面答复的，视为同意受理。