判断隐名投资人股东身份的问题，事实上这也是众多隐名投资纠纷最先需要解决的问题。“隐名股东”以及与之相对应的“显名股东”并不是学理或法律上的特定称谓，而是商事活动中一种约定俗成的说法，一直到《公司法司法解释三》的颁布分别称其为“实际出资人”与“名义出资人”，一般认为才是首次从法律上赋予了两者正式地位，并明确了二者的权利义务与相应责任。
判断隐名股东和显名股东的股东身份，强烈依赖于股东名册、工商登记、公司章程等多项形式要件形成的证据链，以及是否能提供出资证明、是否参与公司实际经营、是否定期参加公司的盈余分配以及是否承担经营风险等实质证据所体现出来的当事人之间的真实意思。在司法审判中，法院往往会根据案件情形，选择究竟是更侧重于采信形式证据还是实质证据。
具体而言，针对股东内部之间的纠纷，法官会更侧重于实质要件的判断，比如根据隐名股东与显名股东所签订的投资协议尽可能还原双方在签订协议之时最真实的意思表示，在合法的基础上充分尊重自治，或通过参考双方是否参与了经营管理，是否享受定期分红、承担运营风险等行为，来判断当事人是否享有或履行了作为一个股东应当享有或履行的权利与义务。因此从对内关系来说，法官更侧重于遵循意思自治原则和诚信原则。然而当遇到对外纠纷，尤其是存在善意第三人的纠纷时，法官则会基本遵循外观主义原则与公示主义原则，以保护善意第三人的权益并全面维护商事关系的稳定性。由于善意第三人对股东身份的判断一般是基于对公司章程、股东名册、工商登记等外在形式要件所记载的信息的合理信赖，因此法官在证据的采信上也会从照顾善意第三人的角度出发，更侧重于采纳形式要件所构成的证据链来确定究竟谁才是实体承担权利义务的股东。
代持股协议是隐名股东和显名股东签订的，属于有效的协议，对于双方当事人来说有约束力，当名义股东在公司盈利时分配说的的股权利润之后，应当将利润所得归还隐名股东。
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