兼并合同存在纠纷流程

确定对象、资产评估、签署协议。
（一）、初步确定兼并方和被兼并方企业。
兼并方和被兼并方企业一般通过产权市场或者直接洽谈的方式予以初步确定。
（二）、清产核资和财务审计。
企业兼并，必须由直接持有该国有产权的单位决定聘请具备资格的会计师事务所进行财务审计。如果经过兼并，企业改制为非国有制企业，还要对企业的法定代表人进行离任审计。被兼并企业必须按照有关规定向会计师事务所或者政府审计部门提供有关财务会计资料和文件。
（三）、资产评估。
企业采取兼并形式进行改制的，必须按照《国有资产评估管理办法》的规定，对资产实施评估。资产评估的范围包括固定资产、流动资产、无形资产(包括知识产权和商誉，但是不包括以无形资产对待的国有土地使用权)和其他资产。对于非国有投资者兼并企业的，由直接持有该国有产权的单位决定聘请具备资格的资产评估事务所对资产进行评估。
（四)、确定产权底价。
被兼并企业应当以有关主管部门确认的评估值为依据，合理确定出售底价。并可以通过招标、投标的方式确定成交价。成交价不得低于底价。
（五）、签署兼并协议和转让价款管理。
（六）、办理产权转让的清算手续和法律手续。
法律依据：
《关于企业兼并的暂行办法》第四条
企业兼并主要有以下几种形式:
(1)承担债务式，即在资产与债务等价的情况下，兼并方以承担被兼并方债务为条件接收其资产;
(2)购买式，即兼并方出资购买被兼并方企业的资产;
(3)吸收股份式，即被兼并企业的所有者将被兼并企业的净资产作为股金投人兼并方，成为兼并方企业的一个股东;
(4)控股式，即一个企业通过购买其他企业的股权，达到控股，实现兼并。