特种养殖证归哪个部门

根据现行法律法规规定，所有商业营业执照均须由当地工商行政管理局进行统一核发与管理；在此基础上，对于某些特定类型的养殖业，还需另行申请获得相关环境保护部门颁发的许可资质证书。主要负责人应于启动运营前前往其运营场所所在地区的税务机关，依法提出注册登记申请。申请时，必须递交包括《企业法人登记申请书》在内的完备材料，另附有个人身份证件及运营现场的相应证明文件。

解析：
所有的营业执照均须经由中华人民共和国国家市场监督管理总局进行统一管理与审批。
然而，对於涉及到特定养殖活动的业务，还必须获取相应的许可证，此类证件则需向当地农业农村部提出申请并获得批准。如欲申请登记成为个体工商户，须前往经营场所所在地区的登记机关履行相关注册手续。在注册过程中，申请人应递交务必齐全的文件材料，包括填写完整的登记申请书，个人身份证以及所指明的经营场所证明文件等。
法律依据：
《促进个体工商户发展条例》第八条
申请登记为个体工商户，应当向经营场所所在地登记机关申请注册登记。申请人应当提交登记申请书、身份证明和经营场所证明。
个体工商户登记事项包括经营者姓名和住所、组成形式、经营范围、经营场所。个体工商户使用名称的，名称作为登记事项。