因为违反用人单位规定被辞退，用人单位扣除了之前好几月的工资

1、辞退员工要公正。
辞退的原因一般有两种：一是公司原因，如大面积裁员、组织机构调整等二是个人原因，工作不称职、危害公司利益等。对于个人原因的辞退应当做好全面考核工作，不可偏听偏信，更不能公报私仇。对于曾经为公司做出贡献的员工，应当尽量为其寻找其它合适的岗位。
2、辞退员工要公开。
员工辞退应尽量及时公开辞退理由，以免引起在职员工的胡乱猜测，影响正常的工作秩序。此外，在被辞退员工离开时应当尽量做到让他体面，领导出面召集同事为其开个送行会，在会上对其为公司做出的贡献进行总结。开送行会，不单是考虑被辞退人员，更重要的是向在职员工展示公司良好的企业文化，增加向心力。
3、用人单位除名职工时应注意以下几点：
A、除名只是一种处理形式，不是行政处分。除名的唯一条件，便是职工没有正当理由超过法定期限脱离工作岗位即旷工的。所谓旷工，是指职工未按照正常程序办理请假手续而擅自缺勤。
B、劳动合同制工人因无故旷工超过法定期限被企业除名时，劳动合同自行解除。
C、在批准职工的处分以后，如果受处分的劳动者不服，可以在公布处分以后十日内，向上级领导机关提出书面申诉。