公司克扣员工工资应该如何处理

公司克扣员工工资，属于侵犯了劳动者的合法权益，劳动者可以向当地的劳动行政部门举报，由该部门责令一定期限内支付足额的劳动报酬；逾期不支付的，可以责令加付赔偿金。
法律依据：
《中华人民共和国劳动法》第五十条
工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
《对有关问题的补充规定》第三条
《规定》第十五条中所称“克扣”系指用人单位无正当理由扣减劳动者应得工资（即在劳动者已提供正常劳动的前提下用人单位按劳动合同规定的标准应当支付给劳动者的全部劳动报酬）。不包括以下减发工资的情况：
（1）国家的法律、法规中有明确规定的；
（2）依法签订的劳动合同中有明确规定的；
（3）用人单位依法制定并经职代会批准的厂规、厂纪中有明确规定的；
（4）企业工资总额与经济效益相联系，经济效益下浮时，工资必须下浮的（但支付给劳动者工资不得低于当地最低工资标准）；
（5）因劳动者请事假等相应减发工资等。